微生物菌種鑒定?【答案】:對于一株未知的細菌,首先要用經典鑒定指標進行鑒定,包括形態、生理生化反應、生態特性、生活史、血清學反應以及對噬菌體的敏感性等。接著需要用現代的微生物學鑒定技術包括(G+C)mol%值法、核酸分子雜交法、那么,微生物菌種鑒定?一起來了解一下吧。
注射用水微生物超標要做菌種鑒定
傳統方法細菌做革蘭氏染色 運動性試驗 各種代謝 然后查伯杰氏細菌手冊;用分子做的話提總DNA,pcr擴增16srDNA全長片段,上NCBI數據庫比對,選擇近緣序列構建發育樹鑒定。
真菌的話主要根據形余鄭態,特別是有性型生殖形態鑒定;分子的話一般擴增ITS區域,比對,建樹鑒定。
首先你要確定待鑒定的菌種一定是純種 。如果菌種不純,所觀察到的現象則是混合現象,這樣自然不會得到正確的結果。因此在鑒定之前,首先要將菌種純化。 純化方法,一般有2種:平板劃線單菌落分離法和單細胞分離法。前一種操作簡便,效果良好,適用范圍廣。
菌種鑒定的方法一般有常規鑒定和分子生物學方法:
(1)常規鑒定:菌落形態觀察、革蘭氏染色、菌毛染色、糖類分解實驗、吲哚實驗、淀粉水解實驗、V-P實驗、甲寬吵基紅實驗、檸檬酸鹽利用實驗、硝酸鹽還原實驗、接觸酶實驗等
(2)分子生物學方法:細菌16SrDNA菌種鑒定:提取DNA,特定引物PCR擴增,PCR產物純化測序,進化樹豎巧頌分析;真菌18S rDNA/ITS菌種鑒定流程也是一樣的。
“+”代表陽性;“-”代表陰性。跟醫院里的診斷結果一個意思
"G+"代表革蘭氏陽簡仔燃性;"G-"代表革蘭氏陰性戚仔。
是兩組不同的概攔虛念,要區分概念。
實驗步驟:菌種鑒定工作是各類微生物學實驗室都經常遇到的基礎性工作。不論鑒定對象屬哪一類,其工作步驟都離不開以下三步:①獲得該微生物的純種培養物;②測定一系例必要的鑒定指標;③查找權威性的鑒定手冊。一、經典分類鑒定方法 群體:菌落形態,在半固體或液體培養基中的生長狀態等
* 形態個體:細胞形態,染色反應,各種特殊構造等
*營養要求:能源,碳源,氮源,生長因子等
*生理、生化反應酶;產酶種類和反應物性等
* 代謝產物:種橡灶類,產量,顯色嘩如如反應等
* 經典指標 生態特性:生長溫度,對氧的需要,宿主種類等
* 生活史特點
* 血清學反應
* 噬菌體的敏感性
* 其它
經典分類法
經典分類法是一百多年來進行微生物分類的傳統方法。其特點是人為地選擇幾種形態生理生化特征進行分類,并在分類中將表型特征分為主、次。一般在科以上分類單位以形態特征、科以下分類單位以形態結合生理生化特征加以區分。 * A. 能在 60 o C 以上生長
* B. 細胞大,寬度 1.3~1.8mm ………………… 1. 熱微菌屬 ( Thermomicrobium )
* B. 細胞小,寬度 0.4~0.8mm
* C. 能以葡萄糖為碳源生長
* D. 能在 pH4.5 生長 …………………………… 2. 熱酸菌屬 ( Acidothermus )
* DD. 不能在 pH4.5 生長 …………………………………… 3. 棲熱菌屬 ( Thermus )
* CC. 不能以葡萄糖為唯一碳源 ……………… 4. 棲熱嗜油菌屬 ( 棲熱嗜獅菌屬 Thermoleophilum )
* AA. 不能在 60 o C 以上生長
二、現代分類鑒定方法
* 近年來,隨著分子生物學的發展和各項新技術的廣泛應用,促使微生物分類鑒定工作有了飛速發展。
首先如果你的菌株是自然界中分離得到,就只能鑒定到種,不能鑒定到株,因為多多少少和其他株系的細菌有區別,即便你做了一些特征的鑒定,發現和某一株細菌一模一樣,你也沒有理由說你的細菌就是那一株細菌,因為你不可能把所有的特征槐源都做完,株和株之間的關系就相當于不同的人之間的關系,世界上不可能有完全相同的兩個人。除非你知道你的細菌本來就是某一株細菌擴增出來的(而且要保證沒有變異,否則就是一個新株),可是這樣就沒必要鑒定了搏明擾。
菌種鑒定一般就只要提取基因組DNA,然后PCR擴增16srDNA片段,上GeneBank或者Eztaxon對比即可。一般序列相似度在97%以上就可以認為是同種細菌(當然也有例外,DNA序列僅僅基旦是一個參考指標)。
【答案】:對于一株未知的細菌,首先要用經典鑒定指標進行鑒定,包括形態、生理生化反應、生態特性、生活史、血清學反應以及對噬菌體的敏感性等。接著需要用現代的微生物學鑒定技術包括(G+C)mol%值法、核酸分子雜交法、16SrRNA寡核苷酸測序技術等手段對其進行分基沒析,最終確定手物該細菌屬于畢鋒液哪個種。
以上就是微生物菌種鑒定的全部內容,實驗步驟:菌種鑒定工作是各類微生物學實驗室都經常遇到的基礎性工作。不論鑒定對象屬哪一類,其工作步驟都離不開以下三步:①獲得該微生物的純種培養物;②測定一系例必要的鑒定指標;③查找權威性的鑒定手冊。 一、。